PCR
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qPCR溶解曲线分析:溶解曲线不好?峰值低?怎么办?

2020/8/4

我们通常通过熔解曲线来判断qPCR结果的特异性,理想的熔解曲线应该是单峰,异常的熔解曲线会出现杂峰、双峰、宽峰等可能的情况,下面我们就一起分析一下:

1.双峰现象

a)双峰,较低峰Tm在80℃之前

这种情况考虑到可能存在引物二聚体,建议降低引物浓度或重新设计引物等方式优化。

双峰,较低峰Tm在80℃之前


b)双峰,双峰Tm在80℃以后

①引物特异性过差导致非特异性产物扩增,建议Blast检查引物特异性或重新设计引物。
②gDNA污染,可通过NRC进行确认。若NRC有Ct值,可重新制备模板。


双峰,双峰Tm在80℃以后


2. 熔解曲线单峰但不尖锐

这可能存在大小相近的非特异性产物,可以利用高分辨率琼脂糖电泳确认。

 熔解曲线单峰但不尖锐


3.熔解曲线单峰但Tm值在80℃以前

推测未加模板,仅有引物二聚体的扩增。可利用高分辨率琼脂糖电泳确认或重复实验。


4.有扩增曲线无溶解曲线

可能是熔解程序设置错误,未搜集荧光信号,建议重新实验,增加熔解曲线阶段的信号搜集。


5.熔解曲线峰型杂乱

1)反应体系污染,结合NTC和NRC结果确认污染情况,建议从水,引物,酶和环境等逐一排除污染。
2)试剂暴露在强光或高温下导致试剂失效,建议用新的试剂做对比实验。
3)仪器长时间未校准,建议定期进行仪器校准保养。
4)耗材与仪器不匹配,需确认对应仪器对耗材的要求。


6.两种试剂对比,得到的Tm值不一样
可能是不同试剂的促解链成分或含量不一样,导致解链温度Tm值不一样。

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